После того как Черепашки пережили скачок во времени с помощью атомных часов, они оказываются в 1890 году, где встречают знаменитого сыщика Шерлока Холмса и его помощника доктора Ватсона, идущих по следу профессора Мориарти, который украл атомные часы, намереваясь управлять будущим.

Черепашки должны вернуть атомные часы до того, как Мориарти использует их, чтобы изменить историю и провозгласить себя императором мира.

Пока Эйприл освещает конвенцию по альтернативной энергии в Осло, Норвегия, Черепашки должны разыскать Эрика Красноглазого, современного викинга и его команду, после того как они украли научные записи профессора Свена Свенсона.

В Амстердаме, Нидерланды, Черепашки должны помешать Шреддеру украсть алмаз “Герцогиня”, который нужен Крэнгу для питания его лазерного лезвия.

Однако у Шреддера есть конкуренты: два неуклюжих вора тоже хотят заполучить алмаз.

Черепашки отправляются в путешествие на знаменитом Восточном экспрессе, который следует из Гар де Лион в Париже, Франция, в Стамбул, Турция.

Но Шреддер тоже на борту и планирует использовать новое суперзарядное устройство Крэнга, чтобы запустить Восточный экспресс в крупнейшее в мире нефтяное месторождение.

Шреддер завладевает мифическим мечом Экскалибур и провозглашает себя “Королем Шреддером”.

Черепашки вместе с Мерлином должны отнять его у него, иначе Средневековье сольется с современным миром.

Черепашки и Сплинтер прибывают в Лиссабон, Португалия, как раз к началу ежегодного праздника “Бег быков”.

Тем временем Шреддер и мутанты используют новую тепловую лупу Крэнга, чтобы сжечь город дотла, используя силу Солнца, если Черепашки не смогут их остановить.

Находясь в Париже, Черепашки и Мастер Сплинтер посещают Лувр.

Тем временем из-за некомпетентности Шреддера новый гиперракетный движитель Крэнга превращается в ржавый инкрустатор, с помощью которого он планирует окислить знаменитые достопримечательности и памятники мира, если мировые лидеры не используют свои запасы энергии, чтобы вернуть Технодром на Землю.